Σύμφωνα με τον ΕΟΠΥΥ από τους κανόνες συνταγογράφησης εξαιρούνται οι καρκινοπαθείς , όπως και άλλες ιδιαίτερα σοβαρές κατηγορίες ασθενών.
Η χορήγηση φαρμάκων υψηλού κόστους όπως και τα νοσοκομειακά φάρμακα που δίδονται από τα φαρμακεία του ΕΟΠΥΥ δεν έχουν συμμετοχή ή άλλη επιβάρυνση για τους ασθενείς.
Επίσης, για την χορήγηση αναλώσιμου υλικού και σκευασμάτων ειδών διατροφής σε περιπτώσεις σπάνιων και χρόνιων παθήσεων δεν καταβάλλουν καμία συμμετοχή οι πάσχοντες από σακχαρώδη διαβήτη τύπου (I), οι παραπληγικοί, οι τετραπληγικοί, οι πάσχοντες από σακχαρώδη διαβήτη τύπου (I), οι πάσχοντες από σκλήρυνση κατά πλάκας, όσοι κάνουν χρήση αντλίας ινσουλίνης, οι μεταμοσχευθέντες και οι HIV θετικοί ασθενείς.
Επιπλέον οι πάσχοντες από σακχαρώδη διαβήτη τύπου (II) δεν καταβάλουν συμμετοχή για τη δαπάνη αγοράς συρίγγων ινσουλίνης μιας χρήσης, αναλωσίμων των συσκευών χορήγησης ινσουλίνης και ταινιών μέτρησης σακχάρου στο αίμα.
Επίσης, χορηγούνται δωρεάν ειδικά προϊόντα και σκευάσματα διατροφής σε σπάνιες παθήσεις όπως μεταβολικά νοσήματα, κοιλιοκάκη, δυσαπορρόφηση από συγκεκριμένες παθήσεις κ.λ.π.